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Post by jone447 on Aug 2, 2023 1:02:45 GMT -5
8序列读数和 8.6×10 7的序列读数用于 Ad-Tial1 映射到 mm10 小鼠参考转录组。12% 到 19% 的注释读数显示出特征性的 T 到 C 转换,并且主要映射到成熟和前体 mRNA(图 2a,补充图 2b)。PARalyzer 鉴定了具有 T 到 C 转换的结合位点,对于内源性 TIAL1 和过表达的 Ad-Tial1,分别沿着 9,792 和 9,488 个靶 RNA 分布了 294,140 和 368,715 个结合位点(图 2b,补充 亚洲手机号码列表 图2c )。与 TIAL1 的核质定位和细胞核的完全裂解一致,在 3'UTR 中发现了 31,054 和 39,467 个结合位点(11% 和 11%),在内含子中发现了 217,474 和 280,646 个结合位点(74% 和 76%)(图 2)。 2b,补充图 2d)。 图 2:TIAL1 交联并与靶标 mRNA 结合。 图2 交联的 Tial1 肝脏 viP-CLIP 读数包含特征性 T 到 C 转换,主要映射到前体 mRNA 和 mRNA 类别。b基于 PARalyzer 的结合位点在各种 RNA 种类中的分布主要表明内含子和 3'UTR 结合。c与随机背景(灰线)相比,Tial1 肝脏 viP-CLIP 结合位点(红线)在 3'UTR 上的归一化密度分布。Tial1 结合在聚腺苷酸累。图中显示
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